Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms