Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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