Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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TRIM25Q14258 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TRIM25Q14258 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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