Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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IKZF1Q13422 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IKZF1Q13422 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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