Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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