Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms