Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRE11P49959 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRE11P49959 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRE11P49959 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRE11P49959 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRE11P49959 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms