Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPD1P21695 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPD1P21695 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPD1P21695 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPD1P21695 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPD1P21695 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPD1P21695 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms