Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms