Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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