Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3O43889 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3O43889 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3O43889 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3O43889 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3O43889 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3O43889 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3O43889 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3O43889 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3O43889 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3O43889 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms