Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms