Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms