Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms