Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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VPS29Q9UBQ0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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VPS29Q9UBQ0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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VPS29Q9UBQ0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VPS29Q9UBQ0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VPS29Q9UBQ0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VPS29Q9UBQ0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPS29Q9UBQ0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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