Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF1

GLIS1, Zinc finger protein GLIS1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1Q8NBF1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLIS1Q8NBF1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLIS1Q8NBF1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms