Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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