Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC62Q6P9F0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms