Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms