Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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