Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK4Q16099 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms