Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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