Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms