Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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