Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms