Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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