Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms