Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTRLP40313 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTRLP40313 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms