Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBRP28336 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBRP28336 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBRP28336 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms