Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms