Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD247P20963 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms