Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPBO95292 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms