Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms