Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms