Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U3

SCIN, Adseverin, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCINQ9Y6U3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCINQ9Y6U3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCINQ9Y6U3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCINQ9Y6U3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.6 ms