Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R0

NUMBL, Numb-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBLQ9Y6R0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUMBLQ9Y6R0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBLQ9Y6R0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBLQ9Y6R0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBLQ9Y6R0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBLQ9Y6R0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBLQ9Y6R0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBLQ9Y6R0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms