Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.25■■□□□ 1.793e-32■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 218.53■□□□□ 0.563e-32■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.453e-32■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.395e-7■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.635e-7■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.785e-7■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.195e-7■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.195e-7■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.175e-7■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.175e-7■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.135e-7■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -05e-7■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-6■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 TMED9-204ENST00000507723 1018 ntTSL 215.34■□□□□ 0.052e-6■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 TMED9-206ENST00000513799 772 ntTSL 212.88□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 TMED9-205ENST00000510499 821 ntTSL 29.67□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.53□□□□□ -24e-21■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.114e-21■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 NCL-209ENST00000484328 369 ntTSL 26.94□□□□□ -1.33e-20■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.087e-9■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.077e-9■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.047e-9■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.097e-9■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.117e-9■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.147e-9■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-214ENST00000497648 1319 ntTSL 210.14□□□□□ -0.792e-54■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.42e-54■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.723e-7■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 FASN-205ENST00000584610 857 ntTSL 219.93■□□□□ 0.783e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 FASN-202ENST00000578424 951 ntTSL 219.18■□□□□ 0.663e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-208ENST00000419681 644 ntTSL 516.95■□□□□ 0.33e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.133e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.163e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.413e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.653e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-217ENST00000492298 591 ntTSL 510.85□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.683e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 210.3□□□□□ -0.763e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-211ENST00000464645 560 ntTSL 49.35□□□□□ -0.913e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 ATG16L1-218ENST00000498620 740 ntTSL 58.35□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.12□□□□□ -1.273e-6■□□□□ 9.3
UTP18Q9Y5J1 HSF4-214ENST00000521314 1555 ntTSL 525.21■■□□□ 1.631e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-224ENST00000523562 1839 ntTSL 224.72■■□□□ 1.551e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.541e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-222ENST00000522870 1599 ntTSL 524.2■■□□□ 1.471e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-220ENST00000522295 1539 ntTSL 523.12■■□□□ 1.291e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-201ENST00000434833 1568 ntTSL 1 (best)22.84■■□□□ 1.251e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.251e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.241e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-203ENST00000517685 1249 ntTSL 522.68■■□□□ 1.221e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-204ENST00000517729 556 ntTSL 521.35■■□□□ 1.011e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-216ENST00000521624 1358 ntTSL 1 (best)21.03■□□□□ 0.961e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.941e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.861e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.771e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 DUS1L-204ENST00000542088 1040 ntTSL 318.56■□□□□ 0.561e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 DUS1L-203ENST00000538833 1250 ntTSL 1 (best)18.54■□□□□ 0.561e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 DUS1L-213ENST00000580731 725 ntTSL 517.57■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 DUS1L-209ENST00000578428 688 ntTSL 216.71■□□□□ 0.271e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-205ENST00000517750 546 ntTSL 516.36■□□□□ 0.211e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 DUS1L-210ENST00000578846 4456 ntTSL 215.73■□□□□ 0.111e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 DUS1L-205ENST00000577574 473 ntTSL 515.4■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 DUS1L-212ENST00000579854 657 ntTSL 214.93□□□□□ -0.021e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-208ENST00000519224 637 ntTSL 514.55□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-221ENST00000522459 358 ntTSL 314.54□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 DUS1L-216ENST00000584871 676 ntTSL 214.06□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-202ENST00000517680 368 ntTSL 313.94□□□□□ -0.181e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 212.23□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-207ENST00000519105 227 ntTSL 511.68□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSPA9-213ENST00000524109 1175 ntTSL 510.66□□□□□ -0.71e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 CPNE7-205ENST00000529800 519 ntTSL 510.17□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSF4-219ENST00000522027 447 ntTSL 39.78□□□□□ -0.841e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HSPA9-211ENST00000512328 482 ntTSL 35.14□□□□□ -1.591e-6■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.195e-8■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 SF3B1-206ENST00000462613 141 ntTSL 36.88□□□□□ -1.315e-8■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 27.69□□□□□ -1.182e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-205ENST00000462042 569 ntTSL 36.79□□□□□ -1.322e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-212ENST00000491266 961 ntTSL 36.61□□□□□ -1.352e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-209ENST00000473406 721 ntTSL 56.55□□□□□ -1.362e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 55.4□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 35.38□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 25.37□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 55.36□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.642e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-211ENST00000489450 586 ntTSL 53.94□□□□□ -1.782e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.836e-7■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 PRRC2A-206ENST00000464890 593 ntTSL 216.26■□□□□ 0.196e-7■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 PRRC2A-208ENST00000469577 918 ntTSL 515.17■□□□□ 0.026e-7■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.26e-7■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-218ENST00000583444 2882 nt21.08■□□□□ 0.962e-17■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.613e-7■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.313e-7■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 HNRNPU-202ENST00000366525 2851 ntTSL 510.59□□□□□ -0.713e-7■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 521.23■□□□□ 0.993e-15■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.363e-15■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.013e-15■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.053e-15■□□□□ 9.2
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