Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC42Q9Y546 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC42Q9Y546 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC42Q9Y546 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms