Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP15Q9Y4E8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
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