Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIP1Q9Y3R0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIP1Q9Y3R0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIP1Q9Y3R0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIP1Q9Y3R0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIP1Q9Y3R0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIP1Q9Y3R0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms