Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NUDCQ9Y266 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUDCQ9Y266 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUDCQ9Y266 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms