Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A2Q9UPR5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A2Q9UPR5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms