Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PALD1Q9ULE6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms