Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX1-2Q9UD57 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms