Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB9Q9UBS3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJB9Q9UBS3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms