Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC3IPQ9P2W1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms