Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP1Q9NZI2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP1Q9NZI2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms