Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA8Q9NY65 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA8Q9NY65 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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