Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms