Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.82e-12■■■■■ 375.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF707-224ENST00000532486 3031 ntTSL 218.7■□□□□ 0.582e-12■■■■■ 375.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.422e-12■■■■■ 375.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF707-212ENST00000527561 1252 ntTSL 217.03■□□□□ 0.322e-12■■■■■ 375.8
UTP3Q9NQZ2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.555e-8■■■■■ 374.4
UTP3Q9NQZ2 NAIF1-204ENST00000488519 2049 ntTSL 1 (best)17.84■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 374.4
UTP3Q9NQZ2 NAIF1-203ENST00000470245 963 ntTSL 1 (best)13.86□□□□□ -0.195e-8■■■■■ 374.4
UTP3Q9NQZ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.392e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 HSPBP1-204ENST00000585927 666 ntTSL 527.56■■■□□ 22e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 22e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 FRMD8-207ENST00000531151 548 ntTSL 427.29■■□□□ 1.962e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TPCN2-203ENST00000534832 435 ntTSL 225.89■■□□□ 1.745e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.722e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.682e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 HSPBP1-207ENST00000587959 424 ntTSL 525.38■■□□□ 1.652e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.632e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.612e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.62e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CUTC-201ENST00000370472 727 ntTSL 524.9■■□□□ 1.582e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.572e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TBCB-202ENST00000392178 791 ntTSL 224.71■■□□□ 1.552e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.512e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NIPA2-207ENST00000560039 554 ntTSL 423.9■■□□□ 1.422e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.42e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.392e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 MFSD14C-207ENST00000637811 900 ntTSL 323.76■■□□□ 1.392e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.392e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.352e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.32e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 RAI1-205ENST00000582514 878 ntTSL 223.03■■□□□ 1.282e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.272e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 UHRF1-202ENST00000613817 1859 ntTSL 223■■□□□ 1.272e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.262e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.242e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.182e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TBCB-208ENST00000588385 776 ntTSL 1 (best)22.4■■□□□ 1.182e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.142e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.132e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.12e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.12e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 RARG-208ENST00000548284 556 ntTSL 1 (best)21.7■■□□□ 1.062e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-204ENST00000466164 2228 ntTSL 1 (best)21.68■■□□□ 1.062e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF746-204ENST00000471735 541 ntTSL 421.63■■□□□ 1.052e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DDX51-201ENST00000329073 2341 ntTSL 521.55■■□□□ 1.042e-44■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 RARG-211ENST00000550265 1549 ntTSL 221.54■■□□□ 1.042e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SAAL1-210ENST00000531581 1526 ntTSL 521.5■■□□□ 1.038e-16■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TKFC-210ENST00000529479 1781 ntTSL 1 (best)21.46■■□□□ 1.035e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.022e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-207ENST00000401096 450 ntTSL 521.36■■□□□ 1.012e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.012e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 COPE-207ENST00000597646 868 ntTSL 321.23■□□□□ 0.992e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.962e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.968e-16■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 C5orf56-205ENST00000461203 521 ntTSL 221.05■□□□□ 0.962e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DDX51-205ENST00000545991 1734 ntTSL 521.04■□□□□ 0.962e-44■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.968e-16■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ATPAF2-212ENST00000584205 1298 ntTSL 221.02■□□□□ 0.966e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.926e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NRXN2-211ENST00000466324 3155 ntTSL 520.79■□□□□ 0.922e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSPAN18-211ENST00000533080 840 ntTSL 320.57■□□□□ 0.882e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PBXIP1-204ENST00000490230 853 ntTSL 520.47■□□□□ 0.872e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 COPE-209ENST00000599964 542 ntTSL 420.38■□□□□ 0.852e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.852e-44■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.822e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TBCB-209ENST00000589308 659 ntTSL 320.1■□□□□ 0.812e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.88e-16■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.742e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.722e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSPAN18-209ENST00000520999 871 ntTSL 519.55■□□□□ 0.722e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.722e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 POP5-209ENST00000543355 794 ntTSL 319.42■□□□□ 0.72e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-212ENST00000565339 1818 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.692e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ATPAF2-202ENST00000462733 1737 ntTSL 1 (best)19.28■□□□□ 0.686e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.662e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DDX51-206ENST00000546058 789 ntTSL 519.02■□□□□ 0.642e-44■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NRXN2-208ENST00000437746 643 ntTSL 518.97■□□□□ 0.632e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.622e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.616e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.62e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-216ENST00000569504 2009 ntTSL 218.62■□□□□ 0.572e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.572e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ECH1-212ENST00000600178 1007 ntTSL 218.58■□□□□ 0.562e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ECH1-211ENST00000598707 882 ntTSL 218.33■□□□□ 0.522e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.522e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NRXN2-209ENST00000442300 878 ntTSL 518.23■□□□□ 0.512e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.492e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GCDH-206ENST00000587832 791 ntTSL 218.1■□□□□ 0.495e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TKFC-208ENST00000529092 332 ntTSL 317.98■□□□□ 0.475e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SAAL1-214ENST00000533851 804 ntTSL 217.93■□□□□ 0.465e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SWAP70-204ENST00000526358 813 ntTSL 517.92■□□□□ 0.462e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ECH1-203ENST00000594391 919 ntTSL 517.89■□□□□ 0.452e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GCDH-213ENST00000590627 1051 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.435e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-215ENST00000568990 2517 ntTSL 517.71■□□□□ 0.432e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SWAP70-205ENST00000531814 716 ntTSL 317.61■□□□□ 0.412e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PSMD5-AS1-211ENST00000640066 1970 ntTSL 1 (best)17.6■□□□□ 0.415e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.42e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-15■■■■■ 372.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 328.5 ms